Table 3.

Comparison of nucleotide sequences in rearranged IGH CDR3 leukemic cell DNA (L) and corresponding Guthrie card DNA (G)3-150

Case V N D N J DHJH
1(G)  TGTGCAAGAGATCCC  c TAGTAGTACCAGCT  cgtcc  TTACTACTACTACATGGAC  Dlr-4b  J6 
1(L)  TGTGCAAGAGATCCC  c  TAGTAGTACCAGCT  cgtcc TTACTACTACTACATGGAC  
2(G)  TGTGCAAGAGATCC  GTATAGCAGCTCGTCC  ccaa  TACTACTACATGGAC  DN4  J6 
2(L)  TGTGCAAGAGATCC   GTATAGCAGCTCGTCC  ccaa TACTACTACATGGAC  
3(G)  CAGGGGTCCGTATTTT   TATGGTTCG ccg  CTGGTTCGACCCCTGG  Dxp′-1  J5  
3(L) CAGGGGTCCGTATTTT   TATGGTTCG  ccg  CTGGTTCGACCCCTGG 
4a(G)3-151 TGTGCAAGAGATCCC  aaggat  TAGCAGCTCG  cccct TTACTACTACATGGAC  DN4  J6  
4a(L)  TGTGCAAGAGATCCC aaggat  TAGCAGCTCG  cccct  TTACTACTACATGGAC  
4b(G) TGTGCGAGAGATC  ATTACGATATTTTGACTGGTTATTA  ACTGGTTCGACCCCTG  Dxp-1  J5  
4b(L)  not amplified  
5(G)  not amplified  
5(L)  TGTGCAAGAGA TCCC  cct  TATTACTATGGTTCGGGGAGTTATTATTAC  gttatta CTACTTTGACTACTGG  Dxp′-1  J4  
6(G)  not amplified  
6(L) TGTGCAAGAGATCCC  ccggattc  AGCAGCTCGTCC  cc TTACTACTACTATGGAC  DN4  J6  
7(G)  not amplified  
7(L)  TGTGCGAGATC tgg  TAGTACTACTTT  g  TTGACTACTGGGGCCAA  Dlr-5 J6 
Case V N D N J DHJH
1(G)  TGTGCAAGAGATCCC  c TAGTAGTACCAGCT  cgtcc  TTACTACTACTACATGGAC  Dlr-4b  J6 
1(L)  TGTGCAAGAGATCCC  c  TAGTAGTACCAGCT  cgtcc TTACTACTACTACATGGAC  
2(G)  TGTGCAAGAGATCC  GTATAGCAGCTCGTCC  ccaa  TACTACTACATGGAC  DN4  J6 
2(L)  TGTGCAAGAGATCC   GTATAGCAGCTCGTCC  ccaa TACTACTACATGGAC  
3(G)  CAGGGGTCCGTATTTT   TATGGTTCG ccg  CTGGTTCGACCCCTGG  Dxp′-1  J5  
3(L) CAGGGGTCCGTATTTT   TATGGTTCG  ccg  CTGGTTCGACCCCTGG 
4a(G)3-151 TGTGCAAGAGATCCC  aaggat  TAGCAGCTCG  cccct TTACTACTACATGGAC  DN4  J6  
4a(L)  TGTGCAAGAGATCCC aaggat  TAGCAGCTCG  cccct  TTACTACTACATGGAC  
4b(G) TGTGCGAGAGATC  ATTACGATATTTTGACTGGTTATTA  ACTGGTTCGACCCCTG  Dxp-1  J5  
4b(L)  not amplified  
5(G)  not amplified  
5(L)  TGTGCAAGAGA TCCC  cct  TATTACTATGGTTCGGGGAGTTATTATTAC  gttatta CTACTTTGACTACTGG  Dxp′-1  J4  
6(G)  not amplified  
6(L) TGTGCAAGAGATCCC  ccggattc  AGCAGCTCGTCC  cc TTACTACTACTATGGAC  DN4  J6  
7(G)  not amplified  
7(L)  TGTGCGAGATC tgg  TAGTACTACTTT  g  TTGACTACTGGGGCCAA  Dlr-5 J6 
F3-150

The findings are categorized by IGH region (V, N, D, and J). N-region sequences are given in lowercase letters. Germ-line sequences are identical to those reported in the literature.19-22 

F3-151

Biallelic amplification (4a, 4b) for Guthrie card DNA, but not for leukemic cell DNA (4a only).

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal