Clonal TCR rearrangements in patients with CML at diagnosis and during follow-up samples (n = 18)
| Patient no. . | Date, ddmmmyy . | TCR δ primer pairs . | TCR γ primer pairs . | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 . | 2 . | 3 . | 4 . | 5 . | 6 . | 1 . | 2 . | 3 . | 4 . | 5 . | 6 . | 7 . | 8 . | 9 . | 10 . | 11 . | 12 . | ||
| 5 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 03MAR05 | X* | X* | ||||||||||||||||
| Dasatinib | 11FEB08 | X* | X* | X | |||||||||||||||
| 7 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 31MAR09 | X* | X | X | X* | ||||||||||||||
| Dasatinib | 29SEP09 | X* | X* | ||||||||||||||||
| 15 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 18AUG05 | ||||||||||||||||||
| Dasatinib | 24JUL08 | ||||||||||||||||||
| 17 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 30MAR09 | X | |||||||||||||||||
| Dasatinib | 29SEP09 | X | X | ||||||||||||||||
| 21 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 12MAR07 | X* | |||||||||||||||||
| Imatinib | 14JAN08 | X* | |||||||||||||||||
| 22 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 15NOV06 | X | X | X* | |||||||||||||||
| Imatinib | 15OCT07 | X* | |||||||||||||||||
| 23 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 04OCT05 | X | |||||||||||||||||
| Imatinib | 01MAR06 | ||||||||||||||||||
| 24 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 03FEB06 | ||||||||||||||||||
| Imatinib | 13SEP06 | ||||||||||||||||||
| 25 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 26JAN06 | X | X | ||||||||||||||||
| Imatinib | 01FEB07 | ||||||||||||||||||
| 26 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 04DEC07 | ||||||||||||||||||
| Imatinib | 20NOV08 | ||||||||||||||||||
| 27 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 13OCT05 | X | |||||||||||||||||
| Imatinib | 12FEB07 | X | |||||||||||||||||
| 28 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 24MAY05 | X | |||||||||||||||||
| Imatinib | 04OCT07 | X | |||||||||||||||||
| 29 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 20JUL05 | X | |||||||||||||||||
| Imatinib | 13MAR07 | ||||||||||||||||||
| 30 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 11JAN07 | X | X* | ||||||||||||||||
| Imatinib | 17APR08 | X* | X | X | |||||||||||||||
| 31 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 14FEB07 | X* | |||||||||||||||||
| Imatinib | 07JAN08 | X* | |||||||||||||||||
| 32 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 14SEP05 | X* | X | ||||||||||||||||
| Imatinib | 20FEB07 | X* | |||||||||||||||||
| 33 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 19FEB07 | X | X | X* | |||||||||||||||
| Imatinib | 30JUN08 | X* | |||||||||||||||||
| 34 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 28SEP04 | X | X | X* | |||||||||||||||
| Imatinib | 14SEP05 | X* | |||||||||||||||||
| Patient no. . | Date, ddmmmyy . | TCR δ primer pairs . | TCR γ primer pairs . | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 . | 2 . | 3 . | 4 . | 5 . | 6 . | 1 . | 2 . | 3 . | 4 . | 5 . | 6 . | 7 . | 8 . | 9 . | 10 . | 11 . | 12 . | ||
| 5 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 03MAR05 | X* | X* | ||||||||||||||||
| Dasatinib | 11FEB08 | X* | X* | X | |||||||||||||||
| 7 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 31MAR09 | X* | X | X | X* | ||||||||||||||
| Dasatinib | 29SEP09 | X* | X* | ||||||||||||||||
| 15 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 18AUG05 | ||||||||||||||||||
| Dasatinib | 24JUL08 | ||||||||||||||||||
| 17 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 30MAR09 | X | |||||||||||||||||
| Dasatinib | 29SEP09 | X | X | ||||||||||||||||
| 21 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 12MAR07 | X* | |||||||||||||||||
| Imatinib | 14JAN08 | X* | |||||||||||||||||
| 22 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 15NOV06 | X | X | X* | |||||||||||||||
| Imatinib | 15OCT07 | X* | |||||||||||||||||
| 23 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 04OCT05 | X | |||||||||||||||||
| Imatinib | 01MAR06 | ||||||||||||||||||
| 24 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 03FEB06 | ||||||||||||||||||
| Imatinib | 13SEP06 | ||||||||||||||||||
| 25 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 26JAN06 | X | X | ||||||||||||||||
| Imatinib | 01FEB07 | ||||||||||||||||||
| 26 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 04DEC07 | ||||||||||||||||||
| Imatinib | 20NOV08 | ||||||||||||||||||
| 27 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 13OCT05 | X | |||||||||||||||||
| Imatinib | 12FEB07 | X | |||||||||||||||||
| 28 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 24MAY05 | X | |||||||||||||||||
| Imatinib | 04OCT07 | X | |||||||||||||||||
| 29 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 20JUL05 | X | |||||||||||||||||
| Imatinib | 13MAR07 | ||||||||||||||||||
| 30 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 11JAN07 | X | X* | ||||||||||||||||
| Imatinib | 17APR08 | X* | X | X | |||||||||||||||
| 31 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 14FEB07 | X* | |||||||||||||||||
| Imatinib | 07JAN08 | X* | |||||||||||||||||
| 32 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 14SEP05 | X* | X | ||||||||||||||||
| Imatinib | 20FEB07 | X* | |||||||||||||||||
| 33 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 19FEB07 | X | X | X* | |||||||||||||||
| Imatinib | 30JUN08 | X* | |||||||||||||||||
| 34 | |||||||||||||||||||
| Diagnosis | 28SEP04 | X | X | X* | |||||||||||||||
| Imatinib | 14SEP05 | X* | |||||||||||||||||
Clonality of the lymphocytes was determined by PCR and gel analysis with the use of 12 primer pairs for the TCR γ gene rearrangements and 6 primer pairs for TCR δ gene rearrangements. Positive clonal PCR products were confirmed with the sequencing and are marked in the columns as X.
Identical rearrangements at the diagnosis and follow-up sample.