Table 1.

Association of mutant candidate pre-leukemic driver genes with clonal hematopoiesis defined by WGS-outlier status

Gene symbolNumber of nonoutliers with mutation in gene*Number of WGS outliers with mutation in gene†P value‡ORCandidate gene sourceSignificant?
TET2 12 64 2.5 × 10−46 39.2 Steensma et al18  * 
DNMT3A 22 71 9.5 × 10−46 23.8 Steensma et al18  * 
ASXL1 6 19 4.9 × 10−13 22.5 Steensma et al18  * 
PPM1D 3 15 1.4 × 10−11 35.5 Steensma et al18  * 
JAK2 1 7 3.3 × 10−6 49.5 Steensma et al18  * 
SRSF2 1 5 1.6 × 10−4 35.2 Steensma et al18  * 
BCOR 0 2 .016 Inf Steensma et al18  * 
IDH2 0 2 .016 Inf COSMIC5 * 
MYD88 0 2 .016 Inf COSMIC5 * 
TP53 12 6 .018 3.5 Steensma et al18  * 
KMT2D 3 3 .029 7 Steensma et al18  * 
CBL 1 2 .043 14.1 Steensma et al18  * 
SF3B1 4 3 .046 5.3 Steensma et al18  * 
ATM 0 1 .12 Inf COSMIC5  
GNAS 0 1 .12 Inf Steensma et al18   
GNB1 0 1 .12 Inf Steensma et al18   
KIT 0 1 .12 Inf COSMIC5  
MPL 0 1 .12 Inf COSMIC5  
STAT3 0 1 .12 Inf COSMIC5  
NRAS 1 1 .23 7 COSMIC5  
CUX1 7 2 .31 2 Steensma et al18   
AKAP17A 2 1 .33 3.5 COSMIC5  
ACSS2 3 1 .41 2.3 COSMIC5  
HRC 5 1 .55 1.4 COSMIC5  
GOLGA8B 27 2 .57 0.5 COSMIC5  
CEP112 1 0 1 0 COSMIC5  
CREBBP 1 0 1 0 Steensma et al18   
ROBO1 1 0 1 0 COSMIC5  
SETDB1 1 0 1 0 Steensma et al18   
SYNE1 3 0 1 0 COSMIC5  
UMODL1 2 0 1 0 COSMIC5  
Gene symbolNumber of nonoutliers with mutation in gene*Number of WGS outliers with mutation in gene†P value‡ORCandidate gene sourceSignificant?
TET2 12 64 2.5 × 10−46 39.2 Steensma et al18  * 
DNMT3A 22 71 9.5 × 10−46 23.8 Steensma et al18  * 
ASXL1 6 19 4.9 × 10−13 22.5 Steensma et al18  * 
PPM1D 3 15 1.4 × 10−11 35.5 Steensma et al18  * 
JAK2 1 7 3.3 × 10−6 49.5 Steensma et al18  * 
SRSF2 1 5 1.6 × 10−4 35.2 Steensma et al18  * 
BCOR 0 2 .016 Inf Steensma et al18  * 
IDH2 0 2 .016 Inf COSMIC5 * 
MYD88 0 2 .016 Inf COSMIC5 * 
TP53 12 6 .018 3.5 Steensma et al18  * 
KMT2D 3 3 .029 7 Steensma et al18  * 
CBL 1 2 .043 14.1 Steensma et al18  * 
SF3B1 4 3 .046 5.3 Steensma et al18  * 
ATM 0 1 .12 Inf COSMIC5  
GNAS 0 1 .12 Inf Steensma et al18   
GNB1 0 1 .12 Inf Steensma et al18   
KIT 0 1 .12 Inf COSMIC5  
MPL 0 1 .12 Inf COSMIC5  
STAT3 0 1 .12 Inf COSMIC5  
NRAS 1 1 .23 7 COSMIC5  
CUX1 7 2 .31 2 Steensma et al18   
AKAP17A 2 1 .33 3.5 COSMIC5  
ACSS2 3 1 .41 2.3 COSMIC5  
HRC 5 1 .55 1.4 COSMIC5  
GOLGA8B 27 2 .57 0.5 COSMIC5  
CEP112 1 0 1 0 COSMIC5  
CREBBP 1 0 1 0 Steensma et al18   
ROBO1 1 0 1 0 COSMIC5  
SETDB1 1 0 1 0 Steensma et al18   
SYNE1 3 0 1 0 COSMIC5  
UMODL1 2 0 1 0 COSMIC5  
*

Total number of non–WGS-outliers: n = 9859.

†

Total number of WGS-outliers: n = 1403.

‡

Fisher's exact test.

[ViewLarge]
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal