Comparative genomic hybridization results from the lowest 10% MHC class II–expressing cases, n = 23
Case no. . | MHCII, 6p21 . | Ii, 5q32 . | CIITA, 16p13 . | RFX5, 1q21 . | RFXAP, 13q14 . |
|---|---|---|---|---|---|
| 8 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 11 | ND | ND | ND | ND | ND |
| 12 | Loss | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 15 | No alt | No alt | No alt | Gain | No alt |
| 19 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 58 | No alt | No alt | No alt | Gain | No alt |
| 64 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 65 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 80 | Loss | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 101 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 119 | No alt | Gain | No alt | No alt | No alt |
| 122 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 132 | High gain | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 139 | Gain | No alt | Gain | No alt | No alt |
| 142 | No alt | No alt | No alt | Gain | No alt |
| 152 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 166 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 179 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 203 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 272 | No alt | No alt | No alt | No alt | Gain |
| 277 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 284 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 285 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 322 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 423 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
Case no. . | MHCII, 6p21 . | Ii, 5q32 . | CIITA, 16p13 . | RFX5, 1q21 . | RFXAP, 13q14 . |
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| 8 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 11 | ND | ND | ND | ND | ND |
| 12 | Loss | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 15 | No alt | No alt | No alt | Gain | No alt |
| 19 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 58 | No alt | No alt | No alt | Gain | No alt |
| 64 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 65 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 80 | Loss | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 101 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 119 | No alt | Gain | No alt | No alt | No alt |
| 122 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 132 | High gain | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 139 | Gain | No alt | Gain | No alt | No alt |
| 142 | No alt | No alt | No alt | Gain | No alt |
| 152 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 166 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 179 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 203 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 272 | No alt | No alt | No alt | No alt | Gain |
| 277 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 284 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 285 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 322 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
| 423 | No alt | No alt | No alt | No alt | No alt |
No alt indicates no alteration at that locus; ND, not done.